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Rasgos de calidad del salmón

La pigmentación del filete es uno de los rasgos de calidad hereditaria más interesantes del salmón del Atlántico. El fenotipo se ha medido tanto manualmente como una puntuación SalmoFan como con la ayuda de dispositivos espectroscópicos. También se ha utilizado una medición de Near Infrared (NIR), ya sea como una medición puntual dentro del Norwegian Quality Cut (NQC) o como una medición promedio de todo el filete. Dentro de la población de salmones, existe una amplia variedad de la cantidad de astaxantina por kilo detectada en cada filete. Por lo tanto, es razonable mejorar este rasgo mediante la cría selectiva (Figura 1). La pigmentación del filete se registra anualmente en los full-sibs de nuestros candidatos de cría.

Marcadores SNP

Para cada rasgo genético, los marcadores SNP que se distribuyen uniformemente en todo el genoma del salmón contribuyen de manera diferente. Para mapear la contribución de cada marcador a la pigmentación del filete, se muestrean las aletas adiposas para el genotipado y se conectan al fenotipo de cada animal. A partir de ahí, se estima mediante un estudio de asociación de todo el genoma (GWAS). Para la cepa SalmoBreed de la year-class 2015, se genotipificaron 1.698 peces con una matriz SNP de Affymetrix hecha a medida, NOFSAL03, que consta de más de 50K marcadores SNP.
También se realizó un GWAS para vincular sus medidas individuales de mg / kg-1 de astaxantina en todo el filete con sus expresiones genómicas (Figura 2). El diagrama de Manhattan de este GWAS muestra claramente que un QTL afecta el nivel de pigmentación en un grado mayor que el resto del genoma. También muestra que los componentes menores del resto del genoma contribuyen hasta cierto punto.
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Figure 1: Distribution of the average astaxanthin levels in whole fillet in 3,268 slaughter-sized Atlantic salmon using a commercial NIR imaging scanner (QVision500, Tomra Sorting Solutions, Leuven, Belgium). A level of 1-3 is considered as “poor levels” and you can expect a pale fillet. From 5.5, the astaxanthin levels are “good”, and from 7, the level of astaxanthin is “really good”.

Benchmark Genetics ofrece GS y QTL para pigmentación. Desde 2017 se han implementado estas tecnologías para mejorar la calidad de estos fenotipos. Sin embargo, ha sido parte del programa de reproducción de la variedad SalmoBreed desde 2005, con el objetivo de aumentar constantemente la pigmentación del filete del núcleo de reproducción. Para nuestro producto GS Quality, hemos incluido GS para rendimiento de producción y pigmentación, así como QTL para pigmentación.

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Figure 2: The Manhattan plot shows a clear QTL associated with pigmentation in the muscle tissue for the SalmoBreed population. The plot shows that some areas of the genome is affecting the pigmentation level more than others. This information helps us in selecting animals with a higher performance on tissue color.
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