Métodos de selección

Los programas de cría interna de Benchmark Genetics se basan en la selección familiar. Por ejemplo, nuestros programas del salmón del Atlántico producen más de 800 familias cada año, cada una con un gran número de individuos para su posterior selección y prueba.

¿Por qué selección familiar?

Mediante la comparación de familias en relación con los diferentes rasgos que son importantes en la producción comercial, podemos identificar con precisión a las familias con ventajas genéticas específicas. La selección familiar es crucial sobre todo para rasgos que son difíciles de medir en individuos o que se miden de forma negativa, como el rendimiento del filete o el color. La selección familiar también es una forma efectiva de minimizar los niveles de consanguinidad, ya que tenemos el control de los pedigrís de cada familia.

En rasgos como el crecimiento, donde los fenotipos se miden fácilmente en candidatos para la cría, se pueden seleccionar los individuos de forma eficiente según su rendimiento. En los últimos años, se han desarrollado nuevos métodos genómicos para identificar individuos para la cría según la secuencia de ADN mediante la determinación del genotipo. Al comprender qué genotipos (a menudo, con el uso de SNP: polimorfismos de nucleótidos únicos) se asocian con un excelente rendimiento en cada rasgo, es posible examinar las poblaciones para detectar las crías con mejor rendimiento. La selección genómica ocurre cuando se utiliza un gran número de SNP en cada individuo. En algunos rasgos, donde los SNP únicos se asocian con una gran cantidad de variación (a menudo descrita como QTL: locus del rasgo cuantitativo), se pueden seleccionar los individuos en una pequeña cantidad de SNP. En ambos casos, la determinación de los genotipos ha mejorado la efectividad de la selección mediante la identificación más precisa de los individuos con un rendimiento mejorado. Esto es particularmente importante en rasgos como la enfermedad y la resistencia al parásito. La selección individual se ha implementado en todos nuestros programas internos de cría entre especies.

Un QTL es una posición en la secuencia genética (genoma) asociada con una cantidad significativa de variación de un rasgo. A menudo, se identifica utilizando uno o una pequeña cantidad de SNP. El QTL sugiere que un gen considerable se encuentra cerca de esa posición en el genoma. Los SNP son marcadores genéticos para el QTL y se pueden utilizar en una forma particular de selección llamada selección asistida por marcadores (MAS). En el salmón del Atlántico, se ha identificado un QTL significativo en la resistencia al virus IPN, que representa más del 80 % de la variación genética de la resistencia. Los marcadores de SNP para este QTL se utilizan para la identificación y reproducción a partir de individuos resistentes en el núcleo y para la producción comercial de ovas, lo que reduce el número de brotes de IPN. Los investigadores continúan identificando QTL significativos para otros rasgos. Aunque esté presente en la mayoría de los rasgos, la mayor parte de la variación representa muchos genes donde la selección genómica es más efectiva.

La selección asistida por marcadores para QTL más grandes es un método muy efectivo para los rasgos donde un gen importante representa la mayoría de la variación genética. En la mayoría de los rasgos, sin embargo, la variación genética está controlada por un gran número de genes, cada uno con un pequeño efecto. Para estos rasgos, la selección genómica (GS) es más eficaz en la identificación de individuos para la cría. La selección genómica (GS) es una metodología más completa que el QTL y se adapta mejor a los rasgos controlados por muchos genes. Mediante el uso de métodos genéticos avanzados, podemos seleccionar con éxito animales reproductores con los genes más adecuados para la producción comercial de crías. Nuestros programas de cría de salmón del Atlántico son reconocidos internacionalmente por la calidad de la cría: rápido crecimiento junto con retraso en la madurez sexual, enfermedad y resistencia al parásito, y excelente calidad de la carne. Los piojos de mar son un desafío importante en la cría de salmón. Benchmark Genetics comenzó a utilizar la selección familiar para lograr la resistencia a los piojos de mar a partir de 2007. Debido a que los piojos de mar son un rasgo complejo, pasamos a la selección genómica en 2015. Desde entonces, la tasa de ganancia genética en la resistencia a los piojos de mar ha sido más tres veces mayor.